4. CEU Escuela Internacional de Doctorado (CEINDO)

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    Publication
    USP
    Design, validation and implementation of a software tool for metabolites annotation and identification.2022-08-03

    Se ha diseñado, implementado y validado una herramienta computacional de anotación de metabolitos que: (1) integró metabolitos de diferentes bases de datos basadas en su estructura única; (2) desarrolló un modelo relacional para la explotación de los datos; (3) desarrolló un sistema experto de conocimiento para puntuar las anotaciones en experimentos de matabolómica no dirigida oteniendo evidencia que soporte o refute las mismas en base a las posibilidades de ionización, reglas de intensidad entre diferentes aductos y orden de elución de compuestos en cromatografía de fase reversa. De esta forma, se puede obtener un nivel mayor de confianza sobre las anotaciones y se complementa la técnica de espectrometría en tándem para la identificación de matabolitos. La correcta identificación de metabolitos va a resultar en una mejor interpretación del análisis biológico subsecuente. Esta herramienta es la primera en utilizar información analítica y no analítica para soportar la anotación de metabolitos, aumentando de esta forma el nivel de confianza sobre los metabolitos.