Development of a T cell-based test for immune response diagnosis in COVID-19 infection

Abstract

The latest global pandemic of all is the well-known COVID-19 pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and originated in the city of Wuhan in December 2019. The need to find treatments and immunization tools was crucial. Quantifying the levels, duration, and effectiveness of immune responses against SARS-CoV-2 in each country was decisive in establishing, for example, vaccination intervals or understanding the long-term effects on the population, as well as anticipating the risk of future infection outbreaks with the arrival of new variants. The main objective of this thesis was to establish the specific activation level of T cells focused on vaccination against SARS-CoV-2 in Spain by developing a rapid cellular test starting from a minimally processed sample, such as whole blood. Furthermore, this test was not only performed on healthy volunteers but also on a vulnerable cohort (long-term hemodialysis patients) and, in a heterologous vaccination scenario. Moreover, the levels of specific antibodies against the S protein of the virus in each individual were checked for comparison.

La pandemia global más reciente conocida por todos es la COVID-19 causada por un virus respiratorio llamado SARS-CoV-2 y que se originó en la ciudad de Wuhan, China, en diciembre del 2019. La necesidad de encontrar tratamientos y herramientas de inmunización fue clave. La cuantificación de los niveles, la duración y la eficacia de las respuestas inmunes frente al SARS-CoV-2 en cada país, fue decisiva para establecer, por ejemplo, los intervalos de vacunación o para poder entender los efectos a largo plazo de esta en la población, así como para poder anticiparse al riesgo de futuros brotes de infección con la llegada de las nuevas variantes. El objetivo principal de esta tesis fue establecer el nivel de activación especifica de células T enfocado a la vacunación en España frente a SARS-CoV-2 desarrollando un test celular rápido que partiera de una muestra poco procesada, cómo es la sangre completa. Cabe destacar que no solo se decidió llevar a cabo este test en voluntarios sanos, si no, también en una cohorte vulnerable (pacientes de hemodiálisis a largo plazo) y también en un escenario de vacunación heteróloga. Además, se comprobaron los niveles de anticuerpos específicos contra la proteína S del virus de cada individuo para su comparación.