Molecular basis of quinolone resistance in Escherichia coli from wild birds

Abstract

Nine quinolone resistant (minimal inhibitory concentration [MIC] was  32 g/mL for nalidixic acid,  1 g/mL for ciprofloxacin) isolates of Escherichia coli have been found in wild birds with septicemia. All of the isolates were aerobactin positive. The mechanisms of resistance were characterised by sequencing the quinolone resistance-determining region (QRDR) of the gyrA, gyrB, parC, and parE genes. Sequence analysis of the gyrA gene in all isolates identified only 1 nucleotide substitution at codon Serine-83 for Leucine-83. Sequence analysis of the gyrB, parC, and parE QRDR genes revealed no mutations in any of the isolates. This study was conducted to determine the importance of these genes in the susceptibility of E. coli strains isolated from wild birds to quinolones.

Neuf isolats d’Escherichia coli résistants aux quinolones (concentration minimale inhibitrice de  32 g/mL pour l’acide nalidixique et  1 g/mL pour le ciprofloxacin) ont été trouvés chez des oiseaux sauvages septicémiques. Tous les isolats étaient positifs pour l’aérobactine. Les mécanismes de résistance ont été caractérisés par le séquençage de la région déterminant la résistance aux quinolones (QRDR) des gènes gyrA, gyrB, parC et parE. L’analyse de la séquence du gène gyrA de tous les isolats a permis d’identifier une substitution d’une seule base au codon sérine-83 pour leucine-83. L’analyse de la séquence des gènes gyrB, parC et parE n’a pas permis de démontrer de mutation chez aucun des isolats. Cette étude a été effectuée afin de déterminer l’importance de ces gènes dans la sensibilité aux quinolones des isolats de E. coli provenant d’oiseaux sauvages.