Las patologías digestivas son una de las principales enfermedades que afectan al sector cunícola, debido a su elevada mortalidad y morbilidad, sobre todo en el periodo de destete, lo cual supone una gran pérdida económica y el empeoramiento de los índices productivos. La etiología puede ser muy variada y los signos clínicos muy similares, lo cual dificulta su diagnóstico. Se pueden clasificar según su etiología en: bacterianas, entre las que se encuentran la colibacilosis, clostridiosis, enfermedad de Tyzzer, salmonelosis y enteropatía proliferativa; parasitarias, como la coccidiosis y criptosporidiosis; víricas, como rotavirus o parvovirus; y la enteropatía mucoide o enterocolitis epizoótica del conejo, todavía de etiología desconocida. En este artículo se realiza una breve descripción de todas ellas, sin olvidar que además de controlar el agente causal, se debe tener muy en cuenta la alimentación y manejo de los animales, así como la higiene en la explotación.