A partir del descubrimiento de los encuadres noticiosos latentes extraídos desde una formulación inductiva, se propone un análisis de contenido complejo que considere el índice de importancia de las noticias analizadas, la caracterización de la agenda temática, las funciones básicas de los encuadres y finalmente los encuadres genéricos. El desarrollo de esta propuesta metodológica se basa en el análisis en prensa de las denominadas Enfermedades Raras. Para la resolución empírica del proceso descrito se propone el análisis factorial de componentes principales como método capaz de visibilizar las variables que definirán finalmente los encuadres noticiosos. Para el desarrollo de la investigación y enumerar los factores explicativos sobre las ER, se analizaron 150 noticias siguiendo unos criterios semánticos en común o “semas”, y se seleccionaron las afirmaciones más representativas y que pudiesen definir mejor cada variable. A partir de estas, resultaron 15 grupos de clasificación que se prepararon para ordenarlos según una escala de fuerza o énfasis. Posteriormente se aplicó un análisis factorial mediante el índice KMO (Kaiser‐Meyer‐Olkin) confirmado por la prueba de esfericidad de Barlett. Finalmente, el análisis de contenido complejo revisa las teorías sobre Framing de los investigadores, Iyengard, Entman, Edelman, Semetko y Valkenburg, y se aplican técnicas de análisis multivariante de la varianza.